中心设有六个科室，分别为康复医学科、孤独症儿童康教科、智障儿童康教科、康复工程科、社区康复指导科以及办公室。设有物理疗法（PT）、作业疗法（OT）、语言疗法（ST）、心理治疗（SW）、康复工程、引导式教育、结构化训练、ABA训练、音乐游戏训练、感统训练、蒙特梭利训练、奥尔夫音乐和听统治疗、针灸理疗等具有本中心特色的医教结合康复模式。